Abstract

TRIANA-GUTIERREZ, Rosa Isela et al. Selección de genes de referencia en expresión génica de Citrus sinensis infectados con CLas o CTV mediante RT-qPCR. Rev. mex. fitopatol [online]. 2021, vol.39, n.2, pp.354-370.  Epub Nov 03, 2021. ISSN 2007-8080.  https://doi.org/10.18781/r.mex.fit.2102-2.

Una posible alternativa para el control de CTV y CLas en Citrus sinensis es el empleo de resistencia genética adquirida. El estudio de este mecanismo, requiere normalizar con genes de referencia. Por lo tanto, se desarrolló un protocolo de cuantificación de expresión génica mediante RT-qPCR para evaluar el uso potencial de GAPDH, ACTINA, F-BOX, COX y 18S rRNA como genes de referencia en cítricos. Un total de nueve plantas infectadas con CTV (3), CLas (3) y sanas (3) se emplearon para seleccionar una muestra compuesta de ocho hojas/planta. El protocolo no comercial se desarrolló y optimizó en todas sus etapas variando concentración de reactivos, iniciadores y sustrato de reacción. La extracción del ARN total con CTAB al 2% estuvo en el rango de 200-1000 ng µL-1. La retrotranscripción produjo en promedio 1069 ng µL-1 ADNc. Los productos de los genes de referencia GAPDH, ACTINA y F-BOX exhibieron curvas de disociación sin expresión de dímeros, Ct ≤ 28 y eficiencias de reacción en el rango de 90-110%. En todas las expresiones de genes, muestras con CTV tuvieron los Ct´s más tardíos (25-27) seguido de las muestras sanas (24-25). Sin embargo, GAPDH y ACTINA presentaron la expresión génica más estable (ln 1/M = 2.83) por lo que estos genes se proponen para normalización. El protocolo RT-qPCR fue también específico y eficiente para el gen CDR13, putativamente asociado a resistencia sistémica adquirida a CLas, lo que sugiere su viabilidad en estudios de resistencia de C. sinensis/C. aurantium en respuesta a la infección de CTV y CLas.

Keywords : Transcriptoma; Naranja; CDR13; ACTINA; GAPDH.

        · abstract in English     · text in English | Spanish     · English ( pdf ) | Spanish ( pdf )