Abstract

MARTINEZ-CORDOVA, Luis Rafael et al. Perfil taxonómico de comunidades bacterianas detectadas con 16S-ARNr en biopelículas marinas autotróficas y heterotróficas utilizadas en la acuacultura. Cienc. mar [online]. 2018, vol.44, n.4, pp.251-266.  Epub July 30, 2021. ISSN 0185-3880.  https://doi.org/10.7773/cm.v44i4.2829.

Se estudió la diversidad de bacterias de biopelículas fototróficas (PAb) y heterotróficas (Hb) a través del tiempo (0, 15 y 30 días de cultivo) por medio de secuenciación masiva, considerando las regiones hipervariables V3 y V4 del gen 16S ARNr. La composición bacteriana mostró pequeños cambios durante el ensayo en términos de abundancia relativa y diversidad. Proteobacteria fue el filo más abundante en ambas biopelículas durante el experimento. Chlamidiae-Verrucomicrobia, Bacteriodetes y Planctomycetes también fueron filos abundantes en PAb, mientras que Planctomycetes, Bacteriodetes, Actinobacteria y Chlamydiae se registraron en Hb. De las lecturas asignadas a nivel de especie, un total de 27 especies autrotróficas y heterotróficas fueron detectadas en ambas biopelículas, la mayoría de ellas asociadas al metabolismo de compuestos nitrogenados y azufrados y a materia orgánica, y las restantes asociadas a las funciones estructurales en las biopelículas. Esta es la primera vez que se reporta la detección de algunas de estas especies en estas biopelículas e incluso en el ambiente marino. Los resultados sugieren la existencia de complejas redes de interacción en los conglomerados microbianos formados en las bipelículas, en las cuales las poblaciones bacterianas parecen jugar papeles metabólicos y fisiológicos importantes.

Keywords : biopelícula autotrófica; biopelícula heterotrófica; sistemas basados en microbios; metagenómica dirigida; clasificación taxonómica.