Abstract

REYES-DIAZ, Jesús I.; ARZATE-FERNANDEZ, Amaury M.; PINA-ESCUTIA, José L.  and  VAZQUEZ-GARCIA, Luis M.. Estudio comparativo de la capacidad de discriminación de marcadores de ADN y su efectividad en el establecimiento de relaciones genéticas en el género Tigridia. Agrociencia [online]. 2015, vol.49, n.4, pp.361-372. ISSN 2521-9766.

Tigridia Jussieu es un género endémico de México, su taxonomía es difícil, y la información sobre su variabilidad genética es limitada. Una evaluación de la diversidad usando diferentes marcadores de ADN, como marcadores de inter-secuencias simples repetidas (ISSR) y amplificación aleatoria de ADN polimórfico (RAPD), será útil para establecer una descripción de base amplia, para la conservación de germo-plasma mejorado y la identificación de germoplasma para el mapeo del genoma y el cultivo de estas especies. Así, el objetivo de este estudio fue caracterizar 15 especies silvestres de Tigridia usando marcadores moleculares RAPD e ISSR. Este estudio se realizó en el Laboratorio de Biología Molecular Vegetal de la Facultad de Ciencias Agrícolas de la Universidad Autónoma del Estado de México, entre agosto y noviembre de 2011. En este estudio, 13 iniciadores RAPD de 10, 15 y 20 b y cinco iniciadores ISSR de tipo anclado (ASSR) de 17 b fueron usados para evaluar el nivel de variación genética entre las 15 especies silvestres de Tigridia. Con ambos marcadores se tuvieron 163 bandas amplificadas, de las cuales 150 (92.02%) eran polimórficas. Los iniciadores RAPD de 10 b generaron 12 bandas específicas con un polimorfismo de 95.12 %, para los iniciadores de 15 b esos valores fueron cinco y 82.93 % y ocho y 94.59 % para los de 20 b, respectivamente. Los iniciadores RAPD agrupados presentaron un polimorfismo de 90.76 %, la distancia genética (G_D) entre las especies varió de 0.16 (entre T. illecebrosa y T. huajuapanensis) a 0.57 (entre T. multiflora y T. augusta). Los iniciadores ISSR mostraron más polimorfismo (95.45 %) que los iniciadores RAPD. Con los iniciadores ASSR la asociación genética mayor (G_D=0.89) se observó entre T. mexicana ssp. mexicana y T. durangense, mientras que los menos relacionados fueron T. vanhouttei spp. vanhoutteiy T. multiflora (G_D = 0.14). Este estudio mostró que los iniciadores aleatorios de 10 bases y los iniciadores anclados de 17 bases fueron más eficientes para detectar el polimorfismo y diferenciación genética entre la especies de Tigridia.

Keywords : Iridaceae; RAPD; ASSR; caracterización molecular.

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