Abstract

GRAU, Isel  and  NAPOLES, Gonzalo. Mutación de la proteína proteasa del VIH utilizando optimización basada en colonia de hormigas y mapas cognitivos difusos: análisis de susceptibilidad a fármacos. Comp. y Sist. [online]. 2014, vol.18, n.1, pp.51-63. ISSN 2007-9737.  https://doi.org/10.13053/CyS-18-1-2014-018.

El conocimiento de los mecanismos de resistencia en las mutaciones de las proteínas del VIH es fundamental para optimizar el uso de los fármacos existentes, así como diseñar nuevos medicamentos. Varias técnicas de estadística y aprendizaje automatizado han sido propuestas en la literatura para intentar predecir la resistencia de una mutación a un fármaco determinado usando su información genotípica. Sin embargo el conocimiento disponible públicamente para este tipo de procesamientos está enfocado mayormente a las mutaciones resistentes, lo que provoca bases de conocimiento altamente desbalanceadas que constituyen un serio problema en las tareas de clasificación. En trabajos previos, los autores proponen una metodología para modelar una proteína del VIH como un sistema dinámico a través de Mapas Cognitivos Difusos. Los mapas ajustados obtenidos no solo permiten descubrir conocimiento en la causalidad entre las posiciones de la proteína y la resistencia, sino que alcanza un desempeño competitivo en términos de exactitud de la clasificación. Basado en estos trabajos, en este artículo proponemos un método basado en la técnica de Optimización de Colonias de Hormigas para generar nuevas mutaciones susceptibles utilizando los mapas ajustados y conocimiento biológico heurístico. Como resultado, las mutaciones obtenidas permitirían a los expertos en fármacos contar con mayor información sobre el comportamiento de la proteasa cuando aparece una mutación susceptible.

Keywords : VIH; resistencia a fármacos; mutaciones; mapas cognitivos difusos; modelación; optimización basada en colonia de hormigas.