Abstract

TRUJILLO-FERRARA, José; ROSALES-HERNANDEZ, Martha Cecilia  and  CORREA-BASURTO, José. Homology Modeling and Blind Docking Approach Studies of Pig Heart Fumarase. J. Mex. Chem. Soc [online]. 2007, vol.51, n.3, pp.148-153. ISSN 1870-249X.

La fumarasa es un enzima que podría ser usada como blanco en el diseño de drogas para el tratamiento de infecciones por Helicobacterpylori y Trypanosoma brucei. En este trabajo, se creó la estructura en tercera dimensión (3D) de la fumarasa de corazón de cerdo (FUM P) usando modelado por homología tomando como templete a la fumarasa de Saccharomyces cerevisiae (FUM Y). Después, se usó el programa Q-Site Finder para identificar los posibles sitios de unión de FUM P y FUM Y. Posteriormente, se efectuaron estudios de acoplamiento molecular de un grupo de derivados aril monosustituidos con grupos electrodonadores y electroatractores, sobre la FUM P y la FUM Y, con el fin de validar el modelo por homología. La estructura en 3D de la FUM P mostró alta semejanza estructural (70.33 %) con la estructura cristalina de la FUM Y. Algunos sitios de unión de FUM P identificados con el programa Q-Site Finder corresponden a los sitios A y B de FUM Y. Los resultados de docking mostraron que algunos compuestos interactúan en el sitio A de FUM P FUM Y, siendo los de mayor afinidad aquellos que tienen electroatractores sobre FUM P, lo que sugiere que los efectos electrónicos son los más importantes durante el proceso de reconocimiento para FUM P.

Keywords : Homología; acoplamiento; arilderivados; fumarasa de corazón de cerdo.