Abstract

ROSALES-LEON, Luis; HERNANDEZ-DOMINGUEZ, Eric Edmundo; GAYTAN-MONDRAGON, Samantha  and  RODRIGUEZ-SOTRES, Rogelio. Metal Binding Sites in Plant Soluble Inorganic Pyrophosphatases: An Example of the Use of ROSETTA Design and Hidden Markov Models to Guide the Homology Modeling of Proteins. J. Mex. Chem. Soc [online]. 2012, vol.56, n.1, pp.23-31. ISSN 1870-249X.

En contraste con sus contrapartes bacterianas y animales, la pirofosfatasas inorgánicas solubles de células vegetales son activas como monómeros. La isoformas 1 y 4 de Arabidopsis thaliana se han caracterizado con mayor detalle, pero su estructura tridimensional no está disponible. Aquí, se emplea un protocolo recientemente publicado (ROSETTA design-HMMer), para guiar el modelado por homología en la obtención de modelos confiables de la estructura tridimensional de estas dos proteínas de arabidopsis. Su interacción con iones de magnesio y pirofosfato se analiza in silico.

Keywords : Estructura 3D de proteínas; modelado comparativo estructural; pirofosfatasas EC 3.6.1.1.

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