Resumen

SIMPSON, June et al. Aplicaciones Ómicas en la interacción Planta-Microorganismos: Una visión desde la genómica vegetal. Rev. mex. fitopatol [online]. 2022, vol.40, n.2, pp.263-269.  Epub 03-Oct-2022. ISSN 2007-8080.  https://doi.org/10.18781/r.mex.fit.2202-7.

El desarrollo de la secuenciación de nueva generación ha abierto la posibilidad de llevar a cabo análisis genéticos moleculares detallados en especies no-modelo. Aquí se presentan estrategias para llevar a cabo análisis de RNAseq en Agave tequilana que por primera vez han permitido la identificación y caracterización de genes involucrados en el metabolismo de fructanos y el tiempo de floración en especies de Agave. Basándose en datos in silico, los patrones de expresión de genes individuales fueron determinados y luego confirmados mediante qRT-PCR. Además, los cDNA´s correspondientes a genes de interés fueron clonados y caracterizados funcionalmente en sistemas heterólogos como Pichia pastoris y Arabidopsis thaliana. También se presentan datos obtenidos por análisis de RNAseq del patosistema C. lindemuthianum-P. vulgaris. Usando cepas de C. lindemuthianum que expresan la proteína fluorescente verde, es sencillo dar seguimiento al proceso de infección y se llevó a cabo RNAseq en diferentes etapas del proceso inicial de infección por C. lindemuthianum en P. vulgaris cultivar BAT93 usando razas virulentas o no virulentas de C. lindemuthianum (Raza 1088 y Raza 256 respectivamente). Por lo tanto, pudieron identificarse genes expresados diferencialmente y específicos para reacciones compatibles y no compatibles.

Palabras llave : Agave; ARN-seq; clonación cADN; C. lindemuthianum/P.vulgaris; proceso de infección; virulencia/avirulencia.