Resumen

EDACHE, Emmanuel Israel; UZAIRU, Adamu; MAMZA, Paul Andrew  y  SHALLANGWA, Gideon Adamu. Theoretical Investigation of the Cooperation of Iminoguanidine with the Enzymes-Binding Domain of Covid-19 and Bacterial Lysozyme Inhibitors and their Pharmacokinetic Properties. J. Mex. Chem. Soc [online]. 2022, vol.66, n.4, pp.513-542.  Epub 10-Abr-2023. ISSN 1870-249X.  https://doi.org/10.29356/jmcs.v66i4.1726.

La investigación de tratamientos innovadores para Pseudomonas aeruginosa y SARS-CoV-2 es un campo floreciente. A pesar de que los científicos y las compañías farmacéuticas han hecho contribuciones significativas a la investigación de infecciones por resistencia a múltiples medicamentos desde una variedad de perspectivas, estas enfermedades siguen siendo incurables. Como resultado, el desarrollo de fármacos novedosos y más eficaces para las proteínas asociadas con Pseudomonas aeruginosa y SARS-CoV-2 se ha convertido en una prioridad en los últimos años. En este sentido, la proteína es conocida como un supuesto inhibidor de la lisozima de vertebrados [Pseudomonas aeruginosa] y de la cadena A, proteína espiga S1 [SARS-CoV-2], y es uno de los objetivos clave para el desarrollo de nuevos fármacos candidatos que podrían utilizarse como inhibidores tanto en pseudomonas aeruginosa como en quimioterapias de SARS-CoV-2. Las características estructurales y el mecanismo de unión de ciertos inhibidores de Pseudomonas aeruginosa y el receptor SARS-CoV-2 se investigaron utilizando la Relaciones Cuantitativas de Estructura-Actividad - (QSAR, por sus siglas en inglés), el modelado por homología, el acoplamiento molecular y la simulación de dinámica molecular. Para crear un modelo 3D de los receptores, se utilizó un enfoque de modelado por homología. Las estructuras cristalinas de rayos X del inhibidor de la cadena A de la lisozima de vertebrados (PDB: 4PS6) y la proteína de espiga de cadena A S1 (PDB: 7MZF), respectivamente, se emplearon como plantillas para esta técnica. La estructura final proyectada se obtuvo y examinó con los programas ERRAT, VERIFY3D y PROCHECK, confirmando que el modelo final es creíble. La estructura anticipada se afinó antes de ser empleada en simulaciones de acoplamiento. Los resultados del cribado virtual basado en la estructura generaron dos nuevas y potentes moléculas líderes, los compuestos 7 y 15, que tienen la afinidad más notable con los receptores 3D predichos. El compuesto acoplado 15 fue sometido a una simulación de dinámica molecular (DM) de 1 ns. El compuesto 15 produjo más contactos hidrófobos y de van der Waals, según las simulaciones de MD, y se une más de cerca a la proteína espiga S1 del SARS-CoV-2. La evaluación de la regla de cinco de Lipinski reveló que estos compuestos líderes tenían características farmacológicas significativas. Como resultado, la investigación actual ayudará en el desarrollo y la síntesis de otra clase de inhibidores de la cadena A de la lisozima de vertebrados y los inhibidores de la proteína de espiga de cadena A S1 que restauran las susceptibilidades de los compuestos farmacológicos.

Palabras llave : Pseudomonas aeruginosa; SARS-CoV-2; QSAR; homología; gráficas de Ramachandran; acoplamiento molecular; simulaciones de dinámica molecular; ADME.