Resumo

BENITEZ-CARDOZA, Claudia Guadalupe; RAMIREZ-TORRES, Jesús Néstor  e  VIQUE-SANCHEZ, José Luis. Potential Compounds Interacting in a Specific Potential Site in SARS-CoV-2 Variants, Selected by Molecular Docking. J. Mex. Chem. Soc [online]. 2022, vol.66, n.4, pp.444-454.  Epub 10-Abr-2023. ISSN 1870-249X.  https://doi.org/10.29356/jmcs.v66i4.1805.

El virus SARS-CoV-2 continúa desarrollando variantes y se han propuesto diferentes formas de tratamiento durante esta pandemia de COVID-19. Este estudio propone compuestos para desarrollar un fármaco contra las variantes del SARS-CoV-2, mediante simulaciones de acoplamiento molecular (docking) utilizando una quimioteca de compuestos (502530 compuestos) dirigidos a interactuar en la región entre los aminoácidos (Ser477, Lys478, Pro479, Cys480, Asn481, Gly482, Val483, Lys484, Gly485, Phe486, Asn487, Cys488 y Tyr489) en la RBD en la proteína S del SARS-CoV-2, este es un sitio potencial específico en las variantes del SARS-CoV-2.

Proponemos diez compuestos seleccionados por docking, con una alta probabilidad de interactuar en la región específica en la RBD de las variantes del SARS-CoV-2 (aminoácidos entre 478 y 484), para reducir la interacción entre la proteína S y ACE2. Además, estos compuestos tienen una alta probabilidad de ser seguros en humanos, validados por servidores web de predicción de ADME y toxicidad (PreADMET) para desarrollar un nuevo antiviral adyuvante específico contra variantes del SARS-CoV-2.

Palavras-chave : Proteína S; RBD; COVID-19; variantes del SARS-CoV-2.