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Revista mexicana de física E
versão impressa ISSN 1870-3542
Resumo
JOSE, M.V.; GOVEZENSKY, T. e BOBADILLA, J.R.. Fractional Brownian motion in DNA sequences of bacterial chromosomes: a renormalization group approach. Rev. mex. fís. E [online]. 2010, vol.56, n.1, pp.69-74. ISSN 1870-3542.
El enfoque del grupo de renormalización (RG) muestra que la dispersión relativa de una serie de distancias de tripletes para cada mitad de los cromosomas bacterianos sigue una ley de potencia inversa en función del tamaño de la ventana en una grafica log-log. Estas líneas rectas indican que cuando la mitad de cada cromosoma bacteriano es analizado se obtiene un monofractal. Con este método se ilustra que ciertos pares de tripletes exhiben una simetría bilateral inversa en las 4 bacterias estudiadas. Asimismo, las secuencias de ADN de los genomas de bacterias en su conjunto contienen correlaciones de largo alcance y componentes aleatorios. En particular, el enfoque RG captura una modulación armónica de las leyes de potencia inversa. Se analizan también las distribuciones de frecuencias de las distancias de tripletes y se presenta un patrón oscilatorio que muestra la conocida periodicidad de 3. Se concluye que las fluctuaciones de las series de distancia de tripletes del ADN no son al azar, como en el movimiento Browniano, ni son el resultado de correlaciones de procesos a corto plazo. Por el contrario, la forma de las leyes de potencia inversa revela que la serie de distancias en cualquier posición se ve influida por fluctuaciones que tuvieron lugar a cientos o miles de bases de separación. Este comportamiento es consecuencia de la naturaleza fractal browniana de las series de distancias de tripletes en las secuencias de ADN.
Palavras-chave : Distribución de frecuencias de distancias de tripletes; cromosomas bacterianos; propiedades estadísticas de series de distancias de ADN; renormalización de grupos; exponentes de escalamiento; exponentes de Hurst.