Sr. Editor:

El gen ATM con locus en 11q22.3 codifica para la proteína cinasa nuclear de la ataxia telangiectasia (ATM), que regula el ciclo celular a través de las proteínas P53, BCRA1y RB¹. Lo conforman 66 exones y 65 intrones (Fig. 1A)¹. Algunas de sus variantes genéticas se relacionan con enfermedades como la ataxia telangiectasia y otras patologías inmunometabólicas (Fig. 1)¹,². En población mexicana solo se han reportado variantes de este gen en el cáncer de mama³. El SNV rs11212617, el cual consiste en una transversión A>C en un marco de lectura abierto (C11orf65), ha sido asociado también con diabetes y patologías cardiovasculares⁴, mas no se ha estudiado en México. Con estas consideraciones se analizó el SNV rs11212617 en mexicanos mestizos de acuerdo con los criterios de selección de Chakraborty para la proporción del alelo menor del SNV, por lo cual se incluyeron 269 muestras de DNA de individuos sanos⁴. La detección del SNV se realizó mediante PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism) y electroforesis por isoelectroenfoque por SSCP (Single-Strand Chain Polymorphism), como se reportó previamente (Fig. 1B)⁵, y fue corroborado por secuenciación automatizada. Así, la distribución de alelos en la población analizada muestra las siguientes frecuencias relativas: alelo ancestral A 0.7918 (n = 426) y 0.2081 (n = 112) para el alelo C. Genotipos: homocigotos A 0.639 (n = 172), heterocigotos 0.304 (n = 82) y homocigotos C 0.055 (n = 15). La distribución no presenta diferencias significativas con las frecuencias esperadas (χ² = 1.528; p = 0.216), por lo que la variante está en equilibrio Hardy Weinberg (Tabla 1). La heterocigosidad observada fue de 0.82, la esperada de 0.88 y la máxima de 0.5 (p = 0.71).

Figura 1 A: espectro clínico del varioma y proteoma del gen de la ataxia telangiectasia (ATM). B: electroforesis PAGE20% homogénea y electroferograma de la secuenciación por Sanger de los productos de PCR-FRLP del SNV rs11212617. Las condiciones de amplificación de la PCR y digestión enzimática con HpyCH4III fueron las descritas previamente⁵. La electroforesis de los productos de digestión de PCR se corrieron mediante el equipo PhastSystem™ (Amersham Biosciences) por 1.5 horas. Fase 1.1 10 Vh, 10 mA, 2.0 W, 5 °C, 55 Vh. Fase 1.2 150 V, 1 mA, 2.5 W, 5 °C, 10 Vh, y se diferenciaron por los tamaños y cortes. El fragmento de 209 pb genera dos productos, uno de 153 pb y otro de 56 pb. La banda de 209 pb corresponde al genotipo homocigoto (A/A) (carriles 1 y 2 del gel). Cuando están presentes tres bandas, 209, 153 y 56 pb, respectivamente, corresponde al genotipo heterocigoto (A/C) (carriles 5, 6 y 7 del gel). Finalmente, si hay dos bandas, 153 y 56 pb, corresponde al genotipo homocigoto (C/C) (carriles 3 y 4 del gel), lo cual se corrobora por la secuenciación por Sanger. 

En conclusión el presente reporte es el primer estudio regional y nacional del SNV rs11212617 del gen ATM en mexicanos mestizos, y crea un referente para la realización de futuros estudios de asociación en enfermedades metabólicas, vasculares, oncológicas e infecciosas en población mexicana.