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Hidrobiológica
versión impresa ISSN 0188-8897
Resumen
BISBAL-PARDO, Celia Isabel; DEL RIO-PORTILLA, Miguel Ángel; CASTILLO-PAEZ, Ana y ROCHA-OLIVARES, Axayácatl. Isolation and characterization of new microsatellite markers for the Pacific geoduck (Panopea generosa) using next generation sequencing. Hidrobiológica [online]. 2018, vol.28, n.1, pp.151-155. ISSN 0188-8897.
Antecedentes
Panopea generosa es una almeja de gran tamaño, infáunica y longeva con un valor comercial considerable en Canadá, Estados Unidos y México, y de la que se requiere conocer su estructura genética poblacional a lo largo de su rango de distribución.
Objetivos
Desarrollar nuevos marcadores microsatélites específicos para P. generosa.
Métodos
En este reporte evaluamos 30 loci microsatélites generados mediante secuenciación genómica de siguiente generación (Illumina Hi-Seq 2500).
Resultados
Se identificaron a ocho como marcadores genéticos polimórficos adecuados. El número de alelos por locus varió entre 5 y 22, la heterocigosidad observada entre 0.429 y 0.818 y la esperada entre 0.548 y 0.962. Tres marcadores se desviaron del equilibrio de Hardy-Weinberg, después de la corrección de Dunn-Šidák, como resultado de un déficit de heterocigosidad, sugiriendo la presencia de alelos nulos y se encontró desequilibrio de ligamiento entre dos microsatélites.
Conclusiones
Estos marcadores son altamente informativos y útiles para estudios de genética poblacional encaminados a la implementación de medidas de administración y conservación de este valioso recurso.
Palabras llave : marcadores genéticos; microsatélites; Panopea generosa; secuenciación de siguiente generación.